A direção do SUS é feita em esferas governamentais. Quando abordada em âmbito da União, a direção é compreendida:

Pelo Ministério da Saúde.

Pelo Conselho Nacional de Saúde.

Pelos Conselhos Públicos de Saúde.

Pelo Ministério da Integração Social.

Pela Secretaria Interestadual de Saúde.